Theo công suất thiết kế, trạm xử lý nước rỉ rác lên đến 400 m3/ngày đêm, nhưng từ nhiều tháng nay chỉ đạt từ 40 m3 đến 50 m3/ngày đêm. Nguyên nhân được cho là khâu lọc nano không làm việc hết công suất, mặc dù một số lõi lọc nano đã được thay thế nhưng tình hình không cải thiện.
Hiện lượng nước rỉ rác còn tồn đọng tại hồ chứa Gò Cát hơn 40.000 m3. Công ty Môi trường Đô thị TPHCM đã cho gia cố bờ bao, đồng thời phủ bạt trên các ô chôn rác, tiếp tục tăng cường xe bồn hút lượng nước rỉ rác về công trường Đông Thạnh để xử lý.
Riêng hệ thống xử lý nước rỉ rác mới đang được đầu tư, nhanh nhất phải đến cuối năm 2006 mới có thể triển khai xây dựng.