Căn cứ vào điểm sàn tốt nghiệp THPT, điểm học tập các năm, điểm thi tốt nghiệp THPT của học sinh, nhà trường tự xét tuyển sinh theo nhu cầu riêng. Trên cơ sở tiêu chí về chất lượng ĐH, bộ sẽ công bố nguyên tắc xác định chỉ tiêu tuyển sinh tối đa của các trường để trường tự quyết định số sinh viên tuyển mới trong giới hạn cho phép.
Bộ GD-ĐT cũng đang hoàn tất đề án học phí mới và đề án quy hoạch mạng lưới các trường ĐH, CĐ đến năm 2020 để trình Chính phủ vào cuối năm 2006. Cũng thời điểm này, Bộ GD-ĐT sẽ hoàn thành dự thảo nghị định về mở cơ sở đào tạo ĐH nước ngoài tại VN và liên kết đào tạo của các ĐH VN với ĐH nước ngoài.