Với môn ngoại ngữ, thí sinh phải thi một trong các ngôn ngữ Anh, Nga, Pháp, Trung Quốc, Đức và Nhật. Những thí sinh học ngoại ngữ không đủ 3 năm được thi thay thế bằng môn sử.
Thí sinh thi tốt nghiệp bổ túc THPT 2009 với 6 môn, gồm: văn, toán, lý, hóa, sinh, địa; trong đó 3 môn lý, hóa, sinh sẽ thi trắc nghiệm. Thời gian làm bài thi các môn tự luận 150 phút, trắc nghiệm 60 phút. Thời gian thi sẽ được tổ chức từ ngày 2 đến 4-6.