Trung tâm có nhiệm vụ lập danh sách, quản lý những người có chỉ định ghép mô, bộ phận cơ thể, điều phối việc lấy ghép mô, bộ phận cơ thể người. Đồng thời, tiếp nhận, lập danh sách, quản lý việc cấp thẻ cho người đăng ký hiến mô, bộ phận cơ thể ở người sống và người sau khi chết. Trung tâm cũng chịu trách nhiệm tiếp nhận thông tin từ các ngân hàng mô về số lượng, chủng loại mô hiện có, trên cơ sở đó điều phối việc cung cấp mô cho các đơn vị ghép.

Ngân hàng mô (giác mạc, xương, da...) đã được thành lập ở một số nơi, như Bệnh viện Mắt Trung ương, Học viện Quân y, ĐH Y Hà Nội...