Mục tiêu chính của dự án là nghiên cứu, xây dựng giải pháp thích ứng với biến đổi khí hậu vùng ven biển, chuyển đổi thời vụ thích hợp để tránh thời kỳ thiếu nước ngọt và xâm nhập mặn.
Ngoài ra còn triển khai các giải pháp công trình: xây dựng các hệ thống kiểm soát mặn ở vùng ven biển Gò Công, Bến Tre, Nam Mang Thít, Quản Lộ - Phụng Hiệp, Tứ giác Long Xuyên, đồng thời củng cố các tuyến đê biển, đê cửa sông để kiểm soát mặn và giảm thất thoát nguồn nước.
Dự án được triển khai trong 2 năm 2012-2013, tổng kinh phí 2,08 triệu USD, do Chính phủ Nhật Bản viện trợ không hoàn lại.