Tuy nhiên, do ảnh hưởng của bão, kết hợp với gió mùa Tây Nam hoạt động mạnh nên khu vực giữa và Nam biển Đông, bao gồm cả vùng biển quần đảo Trường Sa, vùng biển từ Bình Thuận đến Cà Mau có gió mạnh cấp 6, giật cấp 7, cấp 8, biển động.
Để đối phó với bão số 3, Bộ Tư lệnh Bộ đội Biên phòng cho biết đến sáng 29-6, đã liên lạc, thông báo cho 231 tàu/2.012 ngư dân đang đánh bắt hải sản ở khu vực quần đảo Hoàng Sa biết vị trí và hướng di chuyển của bão để chủ động di chuyển, phòng tránh.