Đối với các dự án thuộc lĩnh vực không khuyến khích đầu tư, có mục tiêu hoạt động ngành nghề mới mà không rõ, hoặc đăng ký kinh doanh mà chưa đủ điều kiện theo pháp luật quy định thì Sở Kế hoạch và Đầu tư, Ban Quản lý khu Nam TP, Ban Quản lý khu đô thị mới Thủ Thiêm phải thẩm tra kỹ về tiêu chí, thời hạn hoạt động, quy mô vốn đầu tư và phải có ý kiến của bộ quản lý chuyên ngành để tổng hợp trình UBND TP xem xét cấp giấy chứng nhận đầu tư.

Sở Kế hoạch và Đầu tư phải báo cáo hằng quý về tình hình đầu tư nước ngoài trên địa bàn TP theo ngành nghề kinh doanh, quốc gia, vùng lãnh thổ đầu tư và tiến độ triển khai để phân tích tình hình đầu tư. Ngoài ra, phải bảo đảm đủ nhân sự để quản lý các doanh nghiệp sau đăng ký kinh doanh.