Theo đó, Thủ tướng quyết định việc tổ chức lại, giải thể, chuyển đổi sở hữu các công ty này; phê duyệt mục tiêu, chiến lược, kế hoạch dài hạn, ngành, nghề kinh doanh theo đề nghị của HĐQT và ý kiến của bộ quản lý ngành cùng các bộ liên quan.
Bộ trưởng bộ quản lý ngành chỉ đạo triển khai, kiểm tra việc thực hiện mục tiêu, chiến lược, kế hoạch dài hạn đã được Thủ tướng phê duyệt. Theo đề nghị của bộ quản lý ngành và thẩm định của Bộ Nội vụ, Thủ tướng quyết định bổ nhiệm, miễn nhiệm, cách chức, khen thưởng, kỷ luật chủ tịch và thành viên HĐQT. Ngoài ra, bộ trưởng bộ quản lý ngành có quyền quyết định xếp lương, nâng lương, phụ cấp lương đối với chủ tịch và thành viên HĐQT.
VN hiện có 19 tổng công ty Nhà nước đặc biệt quan trọng.