Theo đó, mục tiêu đến năm 2015 sẽ xóa bỏ tình trạng ngập úng thường xuyên trong mùa mưa ở các đô thị loại 2 trở lên. Đồng thời, mở rộng phạm vi phục vụ của các hệ thống thoát nước từ 50%-60% hiện nay lên 70%-80% và xây dựng các tuyến cống thu gom và trạm xử lý nước thải cho các đô thị từ loại 3 trở lên. Các đô thị này thu gom và xử lý từ 40%-50% lượng nước thải sinh hoạt đô thị đạt tiêu chuẩn quy định.
Đến năm 2025, có thể tái sử dụng nước thải từ 20%-30% cho nhu cầu nước tưới cây, rửa đường và các nhu cầu khác tại các đô thị, KCN. Thủ tướng cũng yêu cầu các đô thị triển khai thu phí thoát nước thấp nhất là 10% theo giá nước sạch và xây dựng lộ trình tăng phí thoát nước bảo đảm đến năm 2015 phí thoát nước đáp ứng đủ cho nhu cầu quản lý, vận hành hệ thống trên địa bàn.